Protein–RNA interactions for Protein: O70172

Pip4k2a, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2aO70172 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pip4k2aO70172 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pip4k2aO70172 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pip4k2aO70172 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pip4k2aO70172 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pip4k2aO70172 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pip4k2aO70172 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms