Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HcrtO55241 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HcrtO55241 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HcrtO55241 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HcrtO55241 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HcrtO55241 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HcrtO55241 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HcrtO55241 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HcrtO55241 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HcrtO55241 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HcrtO55241 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HcrtO55241 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HcrtO55241 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HcrtO55241 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HcrtO55241 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HcrtO55241 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HcrtO55241 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HcrtO55241 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HcrtO55241 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HcrtO55241 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
HcrtO55241 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HcrtO55241 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HcrtO55241 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HcrtO55241 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HcrtO55241 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms