Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syngr2O55101 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms