Protein–RNA interactions for Protein: O54915

Nr1i2, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1i2O54915 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Nr1i2O54915 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr1i2O54915 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms