Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rdh16O54909 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16O54909 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms