Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ32

A630076J17Rik, MCG1026332, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630076J17RikJ3QQ32 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A630076J17RikJ3QQ32 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A630076J17RikJ3QQ32 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A630076J17RikJ3QQ32 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A630076J17RikJ3QQ32 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A630076J17RikJ3QQ32 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A630076J17RikJ3QQ32 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A630076J17RikJ3QQ32 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A630076J17RikJ3QQ32 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A630076J17RikJ3QQ32 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A630076J17RikJ3QQ32 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A630076J17RikJ3QQ32 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A630076J17RikJ3QQ32 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A630076J17RikJ3QQ32 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A630076J17RikJ3QQ32 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
A630076J17RikJ3QQ32 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A630076J17RikJ3QQ32 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms