Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21887J3QQ04 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms