Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nkx1-1G3UXB3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx1-1G3UXB3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nkx1-1G3UXB3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nkx1-1G3UXB3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms