Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LctF8VPT3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LctF8VPT3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LctF8VPT3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms