Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M1F7CXU4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M1F7CXU4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M1F7CXU4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms