Protein–RNA interactions for Protein: F7AXR3

Gm17654, Predicted gene, 17654 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17654F7AXR3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17654F7AXR3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17654F7AXR3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17654F7AXR3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17654F7AXR3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17654F7AXR3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17654F7AXR3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm17654F7AXR3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm17654F7AXR3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm17654F7AXR3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms