Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc7bE9Q9Y3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms