Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rexo5D3YW29 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rexo5D3YW29 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rexo5D3YW29 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms