Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nxpe3B9EKK6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nxpe3B9EKK6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nxpe3B9EKK6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms