Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Grik3B1AS29 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms