Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF0

Skint3, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint3A7TZF0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skint3A7TZF0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Skint3A7TZF0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skint3A7TZF0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms