Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Htra4A2RT60 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Htra4A2RT60 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms