Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Pramel3A2AHA7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramel3A2AHA7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramel3A2AHA7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms