Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Myom3A2ABU4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Myom3A2ABU4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Myom3A2ABU4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Myom3A2ABU4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Myom3A2ABU4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Myom3A2ABU4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Myom3A2ABU4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms