Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ2

Abtb1, Ankyrin repeat and BTB/POZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abtb1Q99LJ2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Abtb1Q99LJ2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms