Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hoxc13P50207 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hoxc13P50207 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hoxc13P50207 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc13P50207 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc13P50207 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc13P50207 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc13P50207 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc13P50207 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc13P50207 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc13P50207 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc13P50207 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc13P50207 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc13P50207 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc13P50207 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc13P50207 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc13P50207 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc13P50207 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc13P50207 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc13P50207 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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