Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChmQ9QXG2 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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