Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ube2q1Q7TSS2 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms