Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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