Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx2P81066 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx2P81066 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Rps6kc1-201ENSMUST00000061611 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Irx2P81066 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms