Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PSMB4P28070 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PSMB4P28070 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PSMB4P28070 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms