Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Smim3Q99PE5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Smim3Q99PE5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms