Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Usp27Q8CEG8 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Usp27Q8CEG8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms