Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vwc2Q8C8N3 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms