Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GCAP28676 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GCAP28676 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GCAP28676 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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