Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Prg4Q9JM99 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Prg4Q9JM99 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Prg4Q9JM99 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prg4Q9JM99 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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