Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCLMP48507 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLMP48507 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLMP48507 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLMP48507 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLMP48507 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLMP48507 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLMP48507 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCLMP48507 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCLMP48507 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms