Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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UbbP0CG49 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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UbbP0CG49 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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UbbP0CG49 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
UbbP0CG49 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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