Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tgfb1P04202 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms