Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Taf4E9QAP7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Taf4E9QAP7 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Taf4E9QAP7 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Taf4E9QAP7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms