Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ergic3Q9CQE7 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ergic3Q9CQE7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms