Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-M10.3Q85ZW6 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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H2-M10.3Q85ZW6 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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H2-M10.3Q85ZW6 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-M10.3Q85ZW6 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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