Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Usp9yF8VPU6 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Usp9yF8VPU6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms