Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms