Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CsprsQ99388 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms