Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnih3Q6ZWS4 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih3Q6ZWS4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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