Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms