Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 ACP1-203ENST00000405233 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AL121694.1-201ENST00000554253 671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSEN1P49768 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms