Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CrxO54751 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CrxO54751 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CrxO54751 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CrxO54751 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CrxO54751 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CrxO54751 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CrxO54751 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CrxO54751 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CrxO54751 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CrxO54751 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CrxO54751 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CrxO54751 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Ncoa3-201ENSMUST00000088095 7531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CrxO54751 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CrxO54751 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms