Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVV-1B6SEH8 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.5 ms