Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pdzk1ip1Q9CQH0 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms