Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan1Q99J59 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms