Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RNF34Q969K3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms