Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Neurl3Q8CJC5 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms