Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LgsnQ8CIX8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms